neuroConstruct 1.6.0
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关于 neuroConstruct
神经结构正在UCL神经科学、生理学和药理学系的银实验室开发。神经结构旨在简化生物逼真的神经元的复杂网络的发展，即包含树突形态和现实细胞膜传导的模型。它在 Java 中实现，并为 NEURON 和 GENESIS 模拟器生成脚本文件，支持处于高级开发阶段的其他仿真平台（包括 PSICS、MOOSE 和 PyNN）。它使用最新的神经ML规范，包括MorphML、ChannelML和网络ML。 在威尔康信托、医学研究理事会和欧盟Synapse项目的资助下，开发这一软件成为可能。 神经结构的一些关键特征是： * 神经结构可以导入形态学文件在GENESIS，NEURON，神经，SWC和MorphML格式，以包含在单个细胞或网络模型中，或更多的抽象细胞也可以手动构建。 * 创建定位在 3D 中的基于电导的神经元网络 * 可以为网络指定单元组之间的复杂连接模式 * 模拟脚本可以生成神经，GENESIS，MOOSE，PSICS和PyNN为基础的模拟器（注意：不是每个项目可以生成每个模拟器） * 生物物理上逼真的细胞机制（突触/通道机制）可以从本机脚本文件（*.mod 或 *.g）导入，或使用 ChannelML 从模板创建 * 自动生成代码，记录仿真数据，并可视化/分析神经结构中的数据 * 通过模拟浏览器界面查看和管理录制的模拟运行 * 基于 Python 的脚本接口可用于控制模型生成和执行，允许运行多个模拟进行单元和网络模型优化