RasMol 2.7.5

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SourceForge OpenRasMol 项目是位于此的 RasMol 和 Openrasmol 项目的附属http://rasmol.org。希望源福格 OpenRasMol 项目将为积极合作贡献提供一个方便的协调中心。 RasMol 功能: RasMol 是一个分子图形程序,用于蛋白质、核酸和小分子的可视化。该计划旨在展示、教学和生成出版物质量图像。RasMol 在广泛的架构和操作系统上运行,包括微软 Windows、苹果 Macintosh、UNIX 和 VMS 系统。UNIX 和 VMS 版本需要 8、24 或 32 位彩色 X Windows 显示屏(X11R4 或更晚)。如果当前 X 服务器提供,RasMol 的 X Windows 版本为硬件拨号框和加速共享内存通信(通过 XInput 和 MIT-SHM 扩展)提供了可选支持。 程序读取分子坐标文件,并交互显示屏幕上的各种配色方案和分子表示的分子。目前可用的表示包括深度线框、"Dreiding"棒、空间填充 (CPK) 球体、球和棒、固体和链生物分子带、原子标签和点表面。 如果当前 X 服务器提供,RasMol 的 X Windows 版本为硬件拨号框和加速共享内存通信(通过 XInput 和 MIT-SHM 扩展)提供了可选支持。 该程序读取分子坐标文件,并交互显示分子在屏幕上的各种表示和配色方案。支持的输入文件格式包括蛋白质数据库 (PDB)、Tripos Associates 的炼金术和 Sybyl Mol2 格式、分子设计有限公司 (MDL) Mol 文件格式、明尼苏达州超级计算机中心 (MSC) XYZ (XMol) 格式、CHARMM 格式、CIF 格式和 mmCIF 格式文件。如果文件中不包含连接信息,则会自动计算。加载的分子可以显示为线框键、圆柱"Dreiding"棒键、α 碳微量、空间填充(CPK)球体、大分子带(光滑阴影实线或平行线)、氢键和点表面表示。原子也可以标有任意文本字符串。备用构件和多个 NMR 模型可以经过特殊颜色并在原子标签中标识。分子的不同部分可以独立于分子的其余部分表示和着色,也可以同时以多个表示形式显示。显示的分子可以交互地旋转、翻译、缩放和 z 剪切(板状),使用鼠标、滚动条、命令行或附加的拨号框。RasMol 可以从"脚本"文件(或通过进程间通信)读取准备好的命令列表,以便快速还原给定的图像或视点。RasMol 还可以创建一个脚本文件,其中包含重新生成当前映像所需的命令。最后,渲染的图像可以以各种格式书写,包括栅格或矢量后脚本、GIF、PPM、BMP、PICT、Sun栅格文件或作为 MolScript 输入脚本或 Kinemage。 可以通过键入 "帮助" 或 "帮助" 来访问 RasMol 帮助设施

版本历史记录

  • 版本 RasMol_2.7.5 发布于 2010-12-15
    若干修复和更新
  • 版本 RasMol_2.7.5 发布于 2010-12-15

软件信息